工藤新一与琴酒对视一眼，同时冲向计算机核心。
在踏入数据流的瞬间，工藤新一体内的观测者碎片突然暴动，眼前闪过无数个平行时空的自己——有的与观测者融为一体，有的成为被操控的傀儡，还有的在量子乱流中永远徘徊。
"别被幻象迷惑！"琴酒的声音穿透意识迷雾，他的机械义眼射／出／激光，劈开层层数据屏障。
工藤新一咬紧牙关，将所有关于伙伴们的记忆化作利刃，斩断观测者设下的精神枷锁。当他们终于抵达核心区域时，看到了令人震惊的景象：
观测者的本体竟是由无数个"时间囚徒"的灵魂拼凑而成，而在最中央，漂浮着工藤优作的意识体。
"父亲？！"工藤新一的声音在数据空间中回荡。观测者发出刺耳的笑声，优作的意识体睁开眼睛，眼中闪烁着复杂的光芒："新一，这一切都是为了......"
工藤新一的话被观测者强行打断，整个数据空间开始坍缩。
琴酒突然将工藤新一推出核心区域："我来拖住他！你去找真正的弱点！"
琴酒的身体在坍缩的压力下开始崩解，却仍死死缠住观测者的本体。工藤新一红着眼睛转身，在数据洪流中疯狂寻找线索。
就在这时，他想起了宫野厚司临终前的眼神——那不是恐惧，而是某种隐秘的暗示。
工藤新一集中精神，在记忆深处搜索着金属盒的细节，终于发现盒底刻着的微型代码。当他将这些代码输入量子计算机的控制台时，整个数据空间剧烈震颤，观测者发出痛苦的嘶吼。
核心区域开始瓦解，琴酒的身影在数据流中若隐若现。工藤新一拼尽全力冲过去，抓住他即将消散的手："这次换我带你出去！"
他将所有剩余能量注入琴酒的意识体，在观测者的本体彻底崩溃前的瞬间，带着琴酒冲出数据空间。
地面实验室中，毛利兰和宫野志保正在与最后的傀儡激战。当工藤新一和琴酒破出数据流时，机械阿笠博士启动了实验室的自毁程序。"快逃！"
工藤新一拉起众人冲向出口，身后传来惊天动地的爆／炸声。
废墟之上，琴酒的意识体变得愈发透明："看来这次真的要彻底消失了。"
他将双／枪化作数据流融入工藤新一的掌心，"照顾好那些家伙......还有，别再相信任何人。"
工藤新一握紧手中的数据流，看着琴酒在黎明的曙光中消散。
“不！琴酒！”
远处，警方的直升机正在靠近，而他的视网膜上，一个新的倒计时再次浮现——这次只有三天。观测者的声音若有若无地在耳边响起："游戏，永远不会结束......"
在时空的褶皱里，另一个戴着兜帽的身影正在调试新的量子装置，他的面前摆着一张照片，照片上是幼年工藤新一与宫野厚司的合影。"该启动B计划了。"
这个神秘身影嘴角勾起冷笑，按下了装置上的启动键。一场更惊心动魄的时空博弈，正在黑暗中悄然拉开帷幕……
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